يوجد في قطاع غزة 12 محطة رصد أمطار موزعة على جميع المناطق من الشمال إلى الجنوب واعتماداً على السجلات المطرية 2000-2010 يلاحظ أن معدل الأمطار يختلف من منطقة إلى أخرى وبصورة عامة فإن معدل الأمطار يزداد في المناطق الشمالية من قطاع غزة ويقل تدريجياً في المناطق الجنوبية، حيث يصل معدل الأمطار في شمال قطاع غزة إلى حوالي 450 ملم/العام بينما في جنوب قطاع غزة يصل إلى حوالي 225 ملم/العام. أما بالنسبة لمعدل الأمطار على كامل قطاع غزة فيصل إلى حوالي 365 ملم/العام أي بما مجموعه 133 مليون متر مكعب/العام. ويلاحظ أيضاً أن 20% من مناطق قطاع غزة يتراوح معدل الأمطار بها ما بين 400-500 ملم/العام وأن 50% من المناطق تراوح ما بين 400-300 ملم/العام وأن 30% من المناطق ترواح معدل الأمطار إلى أقل من 300 ملم/العام.
تجدر الإشارة أن الأمطار هي المصدر الرئيسي المغذي للخزان الساحلي في قطاع غزة وعليه فإن زيادة الأمطار وتوزيعها سيكون لها تأثير إيجابي على المياه الجوفية سواء كان من حيث الكمية أو النوعية.. وبالأخذ بعين الاعتبار معدل تسرب مياه الأمطار من خلال الطبقات الغير مشبعة التي تعلو الخزان الجوفي وكذلك امتداد المناطق السكنية وشبكة الطرق وتأثيراتها السلبية في التقليل من معدل تسرب مياه الأمطار، فقد قدرت كميات المياه المغذية للخزان الجوفي إلى حوالي 50 مليون متر مكعب.
يصل معدل الأمطاربشكل عام في شمال قطاع غزة إلى حوالي 450 ملم/السنة ويقل تدريجياَ في جنوب القطاع ليصل إلى حوالي 225 ملم/السنة . وقد حظي قطاع غزة لهذا الموسم 2015/2016 بكميات ماطرة فاقت المعدل العام وتشير المعلومات المتوفرة من دائرة الأرصاد إلى أن المعدل الأمطار لهذا الموسم في قطاع غزة وصل إلى حوالي 486 ملم وهو يمثل ما نسبته 137% من المعدل العام في القطاع والبالغ 356 ملم في السنة، في حين قدر حجم المياه الهاطلة على قطاع غزة لهذا الموسم بحوالي 191 مليون متر مكعب.